环境科学是山东农业大学重点建设学科，也是我国较早从事农业环境保护研究的单位之一。自1985年设立农业环境保护专业以来，经过20年的发展，学科实力不断提高。1993年在原土壤与农业化学专业中设立农业环境保护方向，招收本科生，1998年合并为农业资源与环境专业，2000年，设立环境科学本科专业，于2003年被批准为硕士学位点，现有硕士生导师6人。下设环境生物学、环境生态学、环境化学、环境监测与评价等4个研究方向。该学科目前有专任专业教师10名，办学特色以环境工程和环境安全监测作为环境科学专业两大特色。